缢蛏生长因子受体结合蛋白2基因克隆、时空表达及SNP筛查
赵家熙1 崔宝月2 董迎辉1 姚韩韩1 林志华1
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赵家熙1 崔宝月2 董迎辉1 姚韩韩1 林志华1,. 缢蛏生长因子受体结合蛋白2基因克隆、时空表达及SNP筛查[J]. 海洋研究,2018.5. DOI:.
摘要: 为了探索生长因子受体结合蛋白2(GRB2)在缢蛏生长发育中的作用,本实验基于缢蛏转录组文库,利用SMART RACE技术克隆缢蛏GRB2(Sc-GRB2)基因的cDNA全长序列,分析其在不同组织和发育时期的表达差异,并在外显子中进行了SNP位点筛选。结果表明,Sc-GRB2基因cDNA全长1 223bp,开放阅读框711bp,编码236个氨基酸;氨基酸序列比对发现,缢蛏与文蛤、泥蚶等双壳贝类同源性较高(64%、59%),而与其他物种的同源性为45%58%,表明GRB2基因比较保守;不同组织的荧光定量PCR(qRT-PCR)结果显示,Sc-GRB2基因在缢蛏7个组织中均有表达,其中足中的表达量极显著地高于其他6个组织(P<0.01);在8个发育时期的表达差异分析发现,该基因在稚贝期表达量极显著地高于其他7个时期(P<0.01)。SNP位点筛选结果表明,在Sc-GRB2基因的外显子区域共发现11个SNP位点。
关键词: 缢蛏;生长因子受体结合蛋白2;克隆;SNP
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