摘要: 为获取2001年低温冻存栉孔扇贝感染牡蛎疱疹病毒(Os HV-1)变异株(ZK2001)基因组序列，并分析ZK2001与其他Os HV-1变异株的序列差异和系统发育关系，利用基于长片段PCR的基因组DNA的扩增和富集技术，获取2001年栉孔扇贝感染Os HV-1变异株的基因组DNA；再使用Illumina Hiseq 2500 PE250高通量测序平台对其测序。最后分析ZK2001与Os HV-1其他变异株基因组的序列差异和系统发育关系。测序数据组装后获得8个Scaffold。基因组变异分析结果显示，ZK2001与参考基因组相比存在328个SNP位点，SNP和序列插入/缺失变异是导致Os HV-1基因组序列变异的主要变异类型。系统发育分析结果显示，ZK2001变异株与分离自我国的Os HV-1变异株亲缘关系最近，与分离自欧洲的Os HV-1μvar及其相关变异株的亲缘关系最远，说明中国和欧洲分布Os HV-1间存在因地理隔离导致的遗传分化。研究表明，基于长片段PCR的DNA富集技术，可以有效地扩增和富集冷冻样本中Os HV-1基因组DNA，并应用于高通量测序。Os HV-1不同变异株基因组序列数据的获取和积累，将为其基因组尺度的基因变异、株系演化和系统发育关系等研究提供重要基础。