长牡蛎酪氨酸酶基因(CgTyr1)SNP多态性与壳色性状的关联
赵博文1 李琪1,2 王九龙1 于红1
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赵博文1 李琪1,2 王九龙1 于红1,. 长牡蛎酪氨酸酶基因(CgTyr1)SNP多态性与壳色性状的关联[J]. 水产研究进展,2020.5. DOI:.
摘要: 黑色素是一种广泛存在于动物界的生物色素,而酪氨酸酶被认为是一种重要的调控黑色素合成的关键酶。实验以3种壳色的长牡蛎选育品系为材料,使用PCR-SSCP的方法对长牡蛎酪氨酸酶基因CgTyr1进行SNP分型筛选,将突变位点与不同壳色性状进行关联分析。结果显示,酪氨酸酶基因的外显子上存在23个SNP位点,其中11个SNP位点与壳色性状极显著相关;在这11个SNP位点中,检测到有3个SNP位点为有义突变(c.591C/T、c.632G/A和c.1155T/C),分别导致不同的氨基酸突变(Ala122Val、Gly136Ser和Phe310Ser);利用极显著关联的11个SNP位点,为每种壳色群体建立了1种单倍型,并在验证组中得到了确认。研究表明,长牡蛎酪氨酸酶基因的单个碱基突变和以此构建的单倍型与壳色性状存在显著的关联。本研究筛选出的SNP位点和构建的单倍型为长牡蛎壳色品系选育提供了重要的参考资料。
关键词: 长牡蛎;壳色;酪氨酸酶基因;SNP;单倍型
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