无患子染色体级别高质量基因组组装成功

近日，中国林业科学研究院亚热带林业研究所林木种质资源研究团队在《经济作物和产品》（Industrial Crops & Products）上发表了研究论文。该研究组装了无患子的染色体级别高质量基因组，分析挖掘了油脂合成候选基因，开发验证了一套特异分子标记，为无患子基因组学研究和种质遗传改良及鉴定评价提供了科学依据。

无患子。中国林科院亚林所供图

无患子果皮富含皂苷，种仁含油率高，秋季叶色金黄，是我国重要的天然洗涤原料、生物质能源和彩化树种。中国林科院亚林所在国内率先系统开展无患子种质资源收集保存、遗传评价和开发利用等工作。2016年在浙江安吉建成我国首个无患子国家林木种质资源库，收集保存了无患子全分布区重要遗传资源。

该研究基于库存种质，结合三代测序和二代测序技术，完成了无患子染色体级别基因组组装。与以往公开的基因组相比，该研究基因组的完整性由83.8%提升至97.64%，并填补了4931个Gaps，极大提高了无患子基因组绘制质量。

此外，通过基因注释和比对分析，研究团队挖掘出6个参与调控无患子种仁油脂合成的候选基因。该研究还基于全基因组序列，开发了20对多态性高、稳定性强的SSR标记，通过346份无患子遗传资源验证了其可靠性，揭示了无患子及其近缘种遗传关系和种质资源丰富的遗传多样性。

该研究得到了浙江省农业（林木）新品种选育重大科技专项、国家科技基础资源调查专项和林业行业标准等项目资助。

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