为研究鲟鱼主要组织相容性复合体（Major histocompatibility complex,MHC）基因的分子特征和表达,利用RACE技术克隆获得了西伯利亚鲟Acipernser baerii MHCⅡβ cDNA序列1443bp,包括开放阅读框（OFR）801bp,编码184个氨基酸。Blast分析显示,由MHCⅡβcDNA基因推导的氨基酸序列同其他物种的一致性为46%～83%,通过Smart站点分析,该序列具有SMART MHCⅡbeta结构域、SMART IGc1结构域和跨膜螺旋结构域;实时定量分析表明,正常情况下MHCⅡβ mRNA在西伯利亚鲟10种组织中均有表达,其中脾、头肾和血液中表达量较高,皮肤和肉中表达量极低（P<0.05）;感染维氏气单胞菌Aeromonas veronii 40h后,脾脏中MHCⅡβ mRNA的表达量显著低于未感染的对照组（P<0.05）,直至93 h时恢复至对照组水平且有显著性变化（P<0.05）。研究表明,MHCⅡβ基因参与了西伯利亚鲟的免疫反应。