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氨基酸性质与蛋白质二级结构的相关分析 下载：74 浏览：471

詹建立 王世锋 《生物技术研究》 2020年5期

摘要:
统计48种氨基酸性质之间的相关性并分析其对蛋白质二级结构的影响。[方法]用r软件对20种氨基酸性质进行分析。[结果]侧链二面角角度柔性等3种性质与Pα相关系数为0.412、0.832、0.477等,以正相关影响α-螺旋的形成,而可压缩系数与Pα相关系数为-0.293,以负相关影响其形成;疏水介热性等17种性质与Pβ的相关系数为0.536、0.867等,以正相关影响β-折叠的形成,而氨基酸极性等6种性质与Pβ的相关系数为-0.547等,以负相关影响其形成;均方根起伏位移与P_t、Pc的相关系数为0.742、0.73,以正相关影响β-转角和无规则卷曲的形成,而膨松度等19种性质与P_t、Pc的相关系数为-0.635、-0.626等,以负相关影响二者的形成。[结论]氨基酸本身信息对蛋白质二级结构有正或负相关的影响。

基于COI基因分析盘羊、塔什库尔干羊的遗传多样性和系统进化 下载：80 浏览：495

王世锋1 安文玉2 詹建立1 张秀英1 王玉涛1 阿布都热合曼·吐尔逊1 《生物技术研究》 2018年6期

摘要:
从线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome c oxidase subumitⅠ,COI)基因水平探讨盘羊对家绵羊有无遗传贡献,了解盘羊和塔什库尔干羊遗传多样性和系统进化。[方法]采用粪便DNA提取法、PCR和测序方法对3只盘羊和68只塔什库尔干羊共71个样品的线粒体COI基因全序列进行分析。[结果]塔什库尔干羊单倍型多样度为0.890±0.001 1,核苷酸多样性为0.00421,表明塔什库尔干羊遗传多样性较为丰富;系统发育分析表明,塔什库尔干羊有4个母系起源,分别是A、B、C和E世系。[结论]欧洲摩弗伦羊对塔什库尔干羊世系B有遗传贡献,基于线粒体COI基因分析,尚未发现盘羊对塔什库尔干羊有遗传贡献的分子证据。
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