清流温郊赤坑萤石矿位于南平~宁化北东东向构造岩浆带东南部，将乐~明溪~清流萤石成矿带的南部，属闽西南拗陷带的北缘。矿体主要呈大脉状、长透镜状赋存于碎裂似斑状中粗粒正长花岗岩的北东向断裂带中，该断裂既是导矿构造，也是储矿构造。矿体形态、产状严格受到断裂控制，矿体与围岩界线清晰，呈突变关系。通过对清流温郊赤坑萤石矿地质特征的总结与分析，初步认为该矿床的成因类型属中低温热液充填交代型脉状矿床。