目的：探究心源性脑梗塞患者应用阿替普酶溶栓治疗的效果。方法：选取我院40例心源性脑梗塞患者，随机分为实验组20例、对照组20例，分别予以阿替普酶溶栓治疗、低分子肝素钙治疗，观察治疗效果。结果：实验组治疗有效率为95.00%、对照组为65.00%，实验组与对照组治疗有效率组间比较差异具备统计学意义（P＜0.05）；治疗后，两组NIHSS及Barthel指数评分组间比较差异具备统计学意义（P＜0.05）。结论：对心源性脑梗塞患者应用阿替普酶溶栓治疗，能显著减轻疾病对患者神经功能损害，提升患者日常活动能力，治疗效果显著，值得推广。