目的探讨经阴道卵巢囊肿剥除术在临床治疗良性卵巢囊肿的疗效,分析临床应用价值。方法选取2015年1月2016年1月在我院手术治疗的84例良性卵巢囊肿患者。随机分为对照组和观察组各42例。对照组采用腹腔镜行囊肿剥除术,观察组采用经阴道卵巢囊肿剥除术,对比两组患者的手术相关指标、手术疗效、并发症发生率以及术后复发率。结果对照组患者手术时间、术后肛门首次排气时间、总的住院时间均要较观察组患者长,术中出血量也比观察组多,各指标相比差异有统计学意义（P<0.05）;对照组治愈率为90.48%,观察组为95.24%,差异无统计学意义（P>0.05）;对照组术后并发症发生率为26.19%,观察组为7.14%,差异有统计学意义（P<0.05）;对照组术后6个月复发率为21.43%,观察组为4.76%,差异有统计学意义（P<0.05）。结论对于良性卵巢囊肿的患者而言,无论是采用经阴道还是腹腔镜手术,均能取得令人满意的效果,而经阴道囊肿剥除术创伤更小,术后恢复更快,并发症以及复发率也更低,值得临床推广借鉴。