目前，我国重大工程建设管理过程中，仍然存在道德风险、资产专用或敲竹杠以及逆向选择等隧道行为，极易引发进度延迟、成本上升、质量下降等风险，甚至导致工程失败。在分析承包商隧道行为的基础上提出业主-承包商合同治理模式，构建委托代理模型，探讨显性合同与关系合同下的激励机制。研究发现，引入关系合同与激励机制能有效防范承包商隧道行为，且能有效促进业主与承包商长期合作；政府作为重大工程管理者，应该引导工程行业建立信息公开平台与承包商筛选机制，从而提升整体行业水平，规范行业企业行为。