南极独特的地理位置和极端环境使南极遗传资源具有重要的经济、生态和科学价值。南极条约协商会议已经讨论南极遗传资源管理近20年,通过了三项决议,但是没有实质性解决南极遗传资源管理问题。本文回顾历史文件,梳理南极遗传资源讨论进程以及存在的焦点问题,包括定义、信息共享、环境保护以及全球进程与南极条约体系互动等。在此基础上,文章比较分析了南极遗传资源采集和科学研究与渔业活动之间的关系,探讨南极条约体系相关原则应用于南极遗传资源的可行性及可能存在的问题。笔者认为未来南极条约协商会议将会解决南极遗传资源操作层次的规则,但是惠益分享因南极条约体系的特殊性而非常复杂,需要谨慎处理。