青花菜钙依赖蛋白激酶基因BoCDPK1的克隆与表达
​邬菲帆 王佳怡 戴晨宇 杨如棉 徐鹏杰 管铭 张慧娟 蒋明
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​邬菲帆 王佳怡 戴晨宇 杨如棉 徐鹏杰 管铭 张慧娟 蒋明,. 青花菜钙依赖蛋白激酶基因BoCDPK1的克隆与表达[J]. 农业学报,2020.3. DOI:.
摘要: 钙依赖蛋白激酶(calcium-dependent protein kinase,CDPK)为Ca2+传感蛋白,在植物生长发育和逆境响应中起着重要作用。在克隆青花菜BoCDPK1基因的基础上,开展序列分析、系统发育分析和表达分析,为后续的基因功能鉴定和抗逆育种奠定基础。该研究以青花菜为材料,利用PCR法克隆1个CDPK基因,利用生物信息学对序列进行分析,并采用qRT-PCR研究该基因在霜霉菌和核盘菌侵染下的表达模式。测序结果表明,BoCDPK1的基因组DNA全长为2 414 bp,具6个内含子,编码区全长为1 647 bp,编码548个氨基酸;BoCDPK1有1个STKc和4个EF手性结构域。多序列比对结果表明,BoCDPK1与芸薹属植物同源序列的相似性最高,仅个别氨基酸残基存在差异,它们在系统发育树上聚于一组。qRT-PCR结果表明,BoCDPK1的表达受霜霉菌和核盘菌的诱导,表达量均呈现先上升后下降的规律。在霜霉菌的诱导下,BoCDPK1的表达量在72 h达最大值,为对照的3.4倍;而在核盘菌侵染下,BoCDPK1的表达量在36 h达最大值。该研究明确了青花菜BoCDPK1基因的序列特点、系统发育关系和表达特征。
关键词: 青花菜;BoCDPK1;表达;霜霉菌;核盘菌
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