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沙眼衣原体LpxA基因克隆及生物信息学分析
李德坤1 雷蕾2 李冉辉3

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李德坤1 雷蕾2 李冉辉3,. 沙眼衣原体LpxA基因克隆及生物信息学分析[J]. 生物技术研究,2018.3. DOI:.
摘要:
克隆沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis)LpxA基因并分析其生物学特性。[方法]根据Ct LpxA基因序列设计特异性引物,利用PCR扩增LpxA基因,并把LpxA基因连接到p MD18-T载体,挑取阳性克隆进行PCR和DNA测序验证。最后使用生物信息学软件分析LpxA蛋白的生物学性质。[结果]从Ct基因组中PCR扩增得到840 bp的Ct LpxA基因,该基因共编码280个氨基酸。LpxA蛋白无信号肽,定位在细菌细胞质。二级结构预测得知α-螺旋占19.6%,延伸链占32.8%,β-转角为11.4%,无规卷曲为36%。三级结构预测得知3个相同的LpxA分子组成同源三聚体。预测得知LpxA蛋白有11个B细胞表位。[结论]克隆得到Ct LpxA基因,并预测了其结构和功能。
关键词: 沙眼衣原体LpxA蛋白基因克隆生物信息学
DOI:
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