舌鳞状细胞癌相关长链非编码RNA的筛选与分析
郭继平1 马光1 王志杰2 齐善厚2 郭美红1
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郭继平1 马光1 王志杰2 齐善厚2 郭美红1,. 舌鳞状细胞癌相关长链非编码RNA的筛选与分析[J]. 生物技术研究,2018.6. DOI:.
摘要:
获得舌鳞状细胞癌组织与正常舌组织中差异表达的长链非编码RNA,并进行功能注释和参与的生理过程进行初步分析。[方法]利用GEO数据库中GES13601的原始芯片数据,采用affymatrix软件套件对芯片数据进行重新均一化和标准化,并筛选差异表达的长链非编码RNA,查找其参与的生理过程。[结果]舌鳞状细胞癌组织与正常舌组织差异表达的基因个数为5 613个。其中在癌组织中上调的为2 951个,下调的共2 662个。从中筛选到长链非编码RNA 38个,上调19个,下调19个。其中的某些参与涉及肌肉、淋巴生长和癌细胞发送等生理过程,但是大部分的功能未知,尚需进一步研究。[结论]筛选到舌鳞状细胞癌相关的38个长链非编码RNA,为寻找早期舌鳞状细胞癌标志物提供了新的参考。
关键词: 舌鳞状细胞癌;长链非编码RNA;基因芯片
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