基于TCGA与Oncomine数据库挖掘MKL-1基因在KIRC中的临床意义
戴周彤 刘美君 王君 李佳蓬 项园 李慧 张慧敏 廖兴华
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戴周彤 刘美君 王君 李佳蓬 项园 李慧 张慧敏 廖兴华,. 基于TCGA与Oncomine数据库挖掘MKL-1基因在KIRC中的临床意义[J]. 生物技术研究,2020.2. DOI:.
摘要:
阐明MKL-1基因在肾透明细胞癌中的表达情况与临床意义。[方法]从TCGA与Oncomine数据库中收集与MKL-1的表达相关的数据,对收集到的数据进行荟萃分析,同时使用Kaplan–Meier方法分析MKL-1的表达量与生存的相关性。[结果]从Oncemine数据库中共收集到154项与MKL-1有关的研究,分析表明在MKL-1在9种癌症中表达上升,且在肾透明细胞癌中的表达显著性上升(P <0. 05)。进一步分析发现MKL-1与癌症患者的特征无显著性关系,但与预后成负相关性。最后通过蛋白质网络预测MKL-1相互作用的蛋白。[结论]基于不同数据库深度挖掘提示MKL-1基因在肾透明细胞癌中高表达,并与肾透明细胞癌的预后有显著相关性,有望被用作肾透明细胞癌的治疗的新靶点。
关键词: MKL-1基因;肾透明细胞癌;TCGA数据库;Oncomine数据库
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