为探明油菜、蚕豆、小麦秸秆还田对稻田土壤nirK型反硝化细菌群落结构的影响,采用IlluminaMiseq高通量测序法,研究了盆栽试验条件下单施化肥（NS）、油菜秸秆+化肥（RS）、蚕豆秸秆+化肥（BS）和小麦秸秆+化肥（WS）4个处理对稻田土壤nirK型反硝化细菌群落多样性及群落结构的影响。结果表明,相比NS处理,秸秆还田（RS、BS和WS处理）对nirK基因微生物的多样性指数没有显著影响（P> 0.05）,而RS处理的微生物多样性指数显著高于BS和WS处理（P <0.05）。Venn分析结果显示,相比NS处理,秸秆还田增加了红螺菌目（Rhodospirillales）。此外,RS处理增加了unclassifiedProteobacteriamiscellaneous,BS和WS处理增加了红细菌目（Rhodobacterales）。相比NS处理,秸秆还田改变了nirK基因微生物的共有目群落组成,而秸秆类型显著改变了共有目的相对丰度。综上所述,还田秸秆类型对nirK基因微生物的多样性和目水平微生物的群落结构均有显著影响,其中油菜秸秆还田的影响强于蚕豆和小麦秸秆。