一般认为，自然主义与奇迹相互冲突。因为奇迹是超自然的事件，而自然主义则认为自然界中不存在任何超自然的事件。然而，通过区分自然主义的两种类型(方法论自然主义与本体论自然主义)，以及对奇迹的两个常见定义(阿奎那式定义与休谟式定义)进行具体分析之后，可以证明，奇迹与自然主义是能够兼容的。我们需要调整的是我们对于自然主义的理解。坚持本体论自然主义，而放弃方法论自然主义，才更加符合自然主义的基本立场。