药品微生物限度检查主要是检查药物原料和辅助材料中所含未指定的杀菌剂和微生物的污染，主要检测真菌、细菌、酵母菌等活微生物的数量是否在规定范围内。药品的微生物限度检测结果是检测药物污染情况的关键性指标。食品微生物检验通过使用微生物学中的理论知识，通过先进的实验室设备以及方法对食品中含有的微生物的类型、含量等进行检测，然后推测这些微生物的存在是否会对人类安全食品构成威胁。微生物检测是为了确保食品安全有效的方法之一。本文详细介绍了工作中两者之间的异同。