为分析鱼类肠道菌群在不同水域环境中的变化，利用16S rRNA高通量测序技术分析了鄱阳湖和青草沙水库大、小2种规格(体质量分别为100～130g、10～30g)短颌鲚(Coilia brachygnathus)(分别记为PYH-L、PYH-S、QCS-L和QCS-S)肠道菌群组成及多样性。结果表明：QCS-L和QCS-S肠道菌群平均OTU分别为524和472个，PYH-L、PYH-S肠道菌群平均OTU分别为466和567个；QCS-L肠道菌群Shannon和Simpson多样性指数均比PYH-L的高，而QCS-S肠道菌群的Shannon和Simpson指数则比PYH-S的低；在不同水域短颌鲚肠道中，每个门类的细菌丰度差异较大，在属水平上伯克霍尔德菌属(Burkholderia)为差异性最大的菌群。研究表明，短颌鲚在不同水域中肠道菌群多样性和丰度的明显差异，极有可能是两地短颌鲚生活史、食性转变和水环境差异造成的。

为比较贵州省黔西南州万峰湖丰水期和枯水期细菌群落组成和多样性，于2020年11月(丰水期)和2021年5月(枯水期)采集了万峰湖3个生态位点(大坝、梅家湾和巴结)表层(0～5m)水体的水样，采用16S rRNA高通量测序技术分析其群落组成。结果表明：3个取样点丰水期细菌的OTUs共1 647个，枯水期细菌的OTUs共1 530个，枯水期细菌丰度高于丰水期，而丰水期细菌群落多样性高于枯水期；在门水平上，丰水期浮游细菌群落主要由变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和蓝藻门(Cyanobacteria)等18门202属细菌组成，枯水期浮游细菌群落则主要由放线菌门、变形菌门和拟杆菌门(Bacteroidetes)等20门236属细菌组成；在属水平上，丰水期和枯水期共有属为55属，147属为丰水期特有，其中放线菌门的Nanopelagicaceae属、蓝菌属(Cyanobium)和羊栖菜弧菌属(Limnohabitans)丰度最高，181属为枯水期特有，其中蓝藻门的Gplla属、土生单胞菌属(Terrimonas)和玫瑰单胞菌属(Roseomonas)丰度最高；PICRUSt功能预测显示，大部分代谢途径中菌群预测的基因拷贝数为枯水期明显高于丰水期。研究表明，万峰湖丰水期和枯水期细菌群落组成和多样性存在明显差异，丰水期和枯水期均有其特有的细菌群落结构，且枯水期菌群代谢比丰水期更活跃。

为探究暗纹东方鲀不同养殖模式下环境及肠道的细菌群落结构特征，实验采用Illumina Miseq高通量测序方法对传统养殖与立体种养2种模式下水体、底泥及暗纹东方鲀肠道细菌的16SrRNA的2个高变区（V3～V4）进行测序分析，利用冗余分析（redundancy analysis，RDA）方法来分析水体菌群与环境因子的关系，使用典型关联分析（canonical correlation analysis，CCA）方法分析肠道菌群与环境因子的关系。结果显示，立体种养模式下水体、底泥及暗纹东方鲀肠道细菌群落的多样性大于传统养殖模式。立体种养模式下水体及底泥的细菌群落结构与传统养殖模式的较为类似，其中水体的优势菌门为放线菌门、蓝细菌门、变形菌门和拟杆菌门；底泥的优势菌门为变形菌门和拟杆菌门。传统养殖模式下，肠道的主要优势菌属为红球菌属，立体种养模式下肠道主要优势菌属为葡萄球菌属、弓形杆菌属、norankfnorank_oChloroplast、Elizabethkingia和支原体属。环境因子关联分析结果显示，pH对水体细菌群落结构具有显著影响。不同养殖模式下水体的优势菌属红球菌属与总悬浮固体（TSS）、总磷（TP）、总氮（TN）、pH和硝酸盐呈正相关。总氨氮（TAN）对暗纹东方鲀肠道细菌群落结构影响最大，暗纹东方鲀肠道的优势菌属红球菌属、弓形杆菌属与TSS、TP呈正相关；不动杆菌属和支原体属与TAN、亚硝酸盐及硝酸盐呈正相关；魏斯氏菌属和葡萄球菌属与TSS、COD、TP、TN、硝酸盐、亚硝酸盐及TAN呈负相关。研究表明，采用立体种养模式可提高养殖系统的细菌多样性，降低病害暴发风险，有助于抑制蓝细菌生长，减小养殖对象的氧化应激损伤。此外，养殖模式能够通过改变水体中氮、磷的含量对水体和暗纹东方鲀肠道的微生物群结构产生一定的影响。

为了解池塘鱼菜立体种养系统中微生物的群落结构特征,探究池塘鱼菜立体种养系统不同组成之间的相互关系,采用Illumina MiSeq高通量测序方法对系统不同组成的微生物16S rRNA V3～V4区进行测序,比较分析了水体、底泥、蕹菜Ipomoea aquatica Forsk根际与根表、暗纹东方鲀Takifugu obscures肠道及凡纳滨对虾Litopenaeus vanname肠道微生物群落多样性及差异。结果表明:池塘鱼菜立体种养系统的6组样品细菌分布于62门1 503属,优势菌门包括变形菌门Proteobacteria (27.71%)、放线菌门Actinobacteria (16.37%)、蓝细菌门Cyanobacteria (16.05%)和拟杆菌门Bacteroidetes (10.07%),主要优势菌属包括红球菌属Rhodococcus、葡萄球菌属Staphylococcus、弓形杆菌属Arcobacter、红杆菌属Rhodobacter、硫杆菌属Thiobacillus和支原体属Mycoplasma;水体的优势菌门为放线菌门、变形菌门、蓝细菌门和拟杆菌门,底泥的优势菌门为变形菌门和拟杆菌门,蕹菜根际及根表的优势菌门为变形菌门、蓝细菌门和拟杆菌门,暗纹东方鲀肠道的优势菌门为厚壁菌门Firmicutes、Epsilonbacteraeota、蓝细菌门和拟杆菌门,凡纳滨对虾肠道的优势菌门为放线菌门和变形菌门;池塘鱼菜立体种养系统中的功能性细菌分布略有不同,蕹菜根表硝化细菌的相对丰度显著高于水体、鲀肠道和虾肠道(P<0.05),蕹菜根际反硝化细菌的相对丰度显著高于其他各组(P<0.05),水体和蕹菜根际固氮菌的相对丰度显著高于虾肠道、底泥和鲀肠道(P<0.05)。研究表明,池塘鱼菜立体种养系统的不同组成(底泥、水体、蕹菜根际与根表、养殖对象肠道)由于功能不同微生物群落结构存在较大差异,在蕹菜根际及根表包含有相对丰度较高的硝化细菌、反硝化细菌、固氮菌,有助于促进氮循环,提高系统中氮的利用率,而养殖对象肠道中既有有益菌也有致病菌属。

目的：探讨并研究高通量测序技术在复发性流产病因诊断中的应用效果。方法：收集我院78例复发性流产患者的流产绒毛组织，应用高通量测序技术（NGS）实施全基因组拷贝数变异检测结果。结果：78例患者流产绒毛组织检测成功78例，检测成功率100%；78例中检测拷贝数异常有37例，占47.4%；37例患者中整条染色体拷贝数增加/减少有29例，部分染色体增加/减少有8例；微缺失/微重复片段有13个。与数据库比较，13个片段中有10个与早期流产、胚胎停育相关的致病性拷贝数变异。结论：高通量测序技术用于复发性流产病因诊断中具有重要作用，检测准确率较高，而且检测分辨率高，能检测出染色体异常，用于复发性流产患者生育具有重要指导作用。