目的了解2015-2017年南宁市手足口病病原谱及其流行特征,为其防控提供科学的参考依据。方法采用实时荧光定量PCR对2015-2017年南宁市采集的南宁市手足口病病例标本进行肠道病毒检测,并对病原学检测数据进行整理分析。结果 2015-2017年,共采集手足口病病例标本4 633例,阳性标本3 886例(83. 88%)。其中EV71型、Cox A16型和他类型的EV的构成比分别为31. 29%,14. 59%,54. 12%。南宁市全年均有手足口病病例报告,发病高峰期为每年的3-11月。每年手足口病病毒的型别特征各不相同。病毒核酸检测阳性病例以5岁以下儿童为主(96. 29%),男性病例阳性检出率(85. 49%)高于女性(80. 97%)(χ2=16. 120,P <0. 001)。1 899例重症患者标本和7例死亡病例标本中,重症病例EV71型阳性率为43. 29%,其他肠道病毒阳性率为47. 68%。死亡病例全部为EV71型。结论南宁市手足口病病原谱变化多样,除了EV71和Cox A16型,还应加强对其他肠道病毒的检测。5岁以下儿童,特别是4岁以下的儿童是防控手足口病,防止病程进展为重症、死亡病例的重点关注的人群。