医教协同下本科学位住院医师规范化培训(住培)并轨硕士专业学位培养政策，有很多优势，但仍存在住培基地与专业硕士研究生培养点不匹配、临床实践时间少、招生专业及培养时间不一致、科研训练不够等问题。可以采取落实医疗机构住培基地与硕士学位点合二为一、强化临床实践教学、加强培训课程体系改革、协调培训时间、重视创新和科研能力培养、完善住培专业医学院校临床硕士学位招生等对策来解决问题。