生态清洁小流域综合效益评价是检验与衡量生态清洁小流域建设成果的有效手段。在分析生态清洁小流域综合效益内涵的基础上,从综合效益评价方法、评价指标体系、确定指标权重的方法等方面介绍了我国生态清洁小流域综合效益评价研究与实践进展,指出了当前研究存在的问题,并从生态清洁小流域建设目标的分类、效益内涵、评价指标体系构建、指标权重确定方法几个方面,对未来生态清洁小流域的综合效益评价研究进行了展望,以期提高生态清洁小流域综合效益评价研究水平,促进生态清洁小流域建设健康发展。