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肺癌中LncRNA的表达及其与预后的相关性 下载：82 浏览：512
摘要:
筛选出在肺癌组织中特异性表达的长链非编码RNA(lncRNA),并探讨其在肺癌中的表达水平与患者预后的相关性。[方法]从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)下载肺癌临床病理和基因表达谱信息。以|Fold Change|>2和校正后的P值(FDR)<0.05为标准筛选差异表达的lncRNA。对差异表达显著的FOXD3-AS1进行RNA结合蛋白(RBP)预测,并用关联矩阵法构建差异表达的lncRNA-RBP-mRNA共表达网络,继而对共表达mRNA进行Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)通路富集分析;通过Kaplan-Meier Plotter方法研究FOXD3-AS1与预后相关性。[结果]共筛选出1 362个在肺癌中差异表达的lncRNA,其中表达上调的1 184个,表达下调的178个。与FOXD3-AS1具有共表达关系的mRNA共有11个。KEGG分析这些共表达的mRNA主要富集在黏着连接、结肠直肠癌和松弛素信号通路,RBP预测发现FOXD3-AS1可以与人丝氨酸/精氨酸富有剪接因子SRSF1结合。FOXD3-AS1与肺癌患者生存曲线具有极显著相关性(P<0.01)。[结论]SRSF1居于lncRNA-RBP-mRNA共表达网络的核心位置,在肺癌的发生、发展中起到重要的调控作用,有望成为肺癌免疫治疗的分子靶标。差异表达的FOXD3-AS1可以很好地判断肺癌患者的预后,因此,可以作为潜在的肺癌检测分子标志物。
菌蜕搭载的埃博霉素促进Caspase-3介导的HeLa细胞凋亡 下载：84 浏览：521
摘要:
初步探讨菌蜕搭载的埃博霉素抑制HeLa细胞增殖的机制。[方法]用半抑制浓度的游离或菌蜕搭载的埃博霉素B分别处理HeLa细胞4～48 h,应用凋亡检测试剂盒分析细胞凋亡情况,应用Caspase-3分析试剂盒检测Caspase-3的活性,并用透射电镜观察细胞的形态变化。[结果]菌蜕搭载的埃博霉素B能更快地诱导HeLa细胞发生时间依赖的凋亡和坏死,处理24 h时早期凋亡细胞及晚期凋亡和坏死细胞的比例分别达32.72%和18.36%,处理48 h时比例分别达23.14%和51.52%。该药物还能诱导更强的Caspase-3激活,处理24 h时其活性约为游离埃博霉素B的1.5倍。Caspase-3活性的升高程度与细胞的早期凋亡程度相平行。该药物处理的HeLa细胞显示典型的凋亡特征。[结论]菌蜕搭载的埃博霉素B能更有效地促进Caspase-3介导的HeLa细胞凋亡。
尾叶桉GLU4无性系F5H基因的克隆表达及序列分析 下载：82 浏览：508
摘要:
克隆尾叶桉(Eucalyptus urophylla)GLU4中F5H基因全长,并对其进行序列和表达模式分析。[方法]根据NCBI公布的F5H基因保守序列设计引物,以尾叶桉GLU4茎部组织为试验材料克隆其g DNA和c DNA片段,利用荧光定量PCR分析其在植株不同组织中的表达模式。[结果]该基因g DNA长2 358 bp,c DNA长1 610 bp,含有2个外显子、1个内含子。开放阅读框编码529个氨基酸,Eu F5H编码的蛋白为一个带负电荷、存在跨膜结构、定位在内质网起始分泌途径中的蛋白质,二级结构包含典型的的α-螺旋和β-折叠,根据三级结构推测其可能具有羟化酶活性。Eu F5H蛋白与蓝桉亲缘关系较近,Eu F5H在不同组织中表达水平差异显著,其中半木质化茎中表达水平相对最高。[结论]成功获得了尾叶桉GLU4木质素合成酶基因F5H的全长序列。
