目的：探讨粪便微生物检验在腹泻患儿中的临床应用价值。方法：选取我院2020年01月-2020年12月期间收治的32例腹泻患儿作为本次研究对象，所有患儿均接受粪便微生物检验及药敏试验，指定本院医学实验室同一名具有高年资、高职称的临床检验医师完成相关操作。记录32例腹泻患儿病原微生物检出情况，以32例腹泻患儿中所占比例较高的2种病原微生物作为研究对象，记录其药敏试验结果。结果：32例腹泻患儿粪便样本中共检出病原微生物32株，其中沙门氏菌（31.25%）、志贺菌（31.25%）所占比例均较高，数据对比P<0.05；32例腹泻患儿粪便中检出比例较高的沙门氏菌对亚胺培南、头孢吡肟敏感性较高（均为100.00%），志贺菌对亚胺培南、复方新诺明敏感性较高（均为100.00%），数据对比P<0.05。结论：腹泻患儿粪便中主要病原微生物为沙门氏菌、志贺菌等，药敏试验显示其对亚胺培南、复方新诺明等抗感染药物敏感性较高，在实际治疗工作中应首选上述药物实施抗感染治疗。