目的：分析微生物检验对医院感染控制及临床合理用药的影响。方法 选取2021年9月至2022年9月500例住院患者进行研究，随机分为观察组（250例，微生物检验用药）与对照组（250例，常规用药）。分析患者感染发生率、感染程度、感染菌种、菌种耐药性分析以及患者对护理满意度。结果 观察组患者感染率显著低于对照组（P<0.05）；观察组患者感染程度显著低于对照组（P<0.05）；本次送检的500例细菌样本中，其中阳性细菌群139例，大肠埃希氏菌为主要分离菌种；对主要分离细菌大肠埃希氏菌进行耐药分析，大肠埃希氏菌对头孢曲松、左氧氟沙星、庆大霉素以及头孢呋辛的耐药性最高；护理满意度对比，观察组患者护理满意度显著高于对照组患者（P<0.05）。结论 微生物检验下可有效降低医院感染发生风险，降低感染严重程度，同时能准确的对感染菌种及细菌耐药性进行分析，从而为临床合理用药提供可靠的依据，值得广泛推广。