生态环境损害赔偿诉讼是特殊的环境民事公益诉讼，该制度所保护的法益侧重于生态利益，即环境要素和生物要素的不利改变，以及上述要素构成的生态系统功能退化。生态环境损害赔偿诉讼的独立价值在于，通过磋商，由涉突发环境事件企业现行垫付前期费用，让“环境有价，损害担责”贯穿于突发环境事件处理的始终，真正落到实处；保障重点生态功能区、禁止开发区内发生的环境污染、生态破坏事件损害赔偿的迅速启动，最大限度控制和挽回不利的生态环境损失。

生态环境损害赔偿磋商是现阶段解决生态环境损害问题的主要途径之一。目前关于生态环境损害赔偿磋商法律性质仍然存在着许多争议。学界目前主要存有民事协议说、行政协议说以及双阶构造说。基于我国对于环境生态保护目标的不断提升和力度的不断加强，整个磋商过程的法律性质应当认定为行政行为，同时将磋商协议认定为行政协议更为适宜。

生态环境损害赔偿金的使用和管理直接影响到生态环境修复程度和制度实施效果,因而生态环境损害赔偿金的管理模式选择及其法律制度构建在当下环境法治中具有迫切的现实意义，在本文结合我国国情,生态环境损害赔偿基金法律制度建构应当从完善上位法依据、创新资金支持渠道、丰富基金组建模式、构建分权管理的基金监督体制四个层面逐步展开。