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人TCF7L2基因启动子生物信息学分析 下载:83 浏览:500
摘要:
探讨人TCF7L2基因启动子特征。[方法]从UCSC数据库获得人TCF7L2基因5'调控区2 000 bp序列,利用多种在线软件对启动子、转录因子结合位点、Cp G岛、SNP等进行分析。[结果]5'调控区2 000 bp序列正义链上至少存在5个潜在的启动子,其中-242~-192 bp、-853~-803 bp之间可能包含核心启动子。查找到1个TATA盒,存在1个长度为499 bp的Cp G岛。Ali Baba2. 1、PROMO和JASPAR软件分别预测到241、944、1 035(正义链)个转录因子结合位点。利用conreal程序在人和小鼠TCF7L2基因启动子保守区域内预测到207个共同的转录因子结合位点,涉及到66种转录因子。启动子区发现2个SNP位点。[结论]对人TCF7L2基因启动子进行了生物信息学分析,获得了启动子特征。
基于TCGA与Oncomine数据库挖掘MKL-1基因在KIRC中的临床意义 下载:76 浏览:518
摘要:
阐明MKL-1基因在肾透明细胞癌中的表达情况与临床意义。[方法]从TCGA与Oncomine数据库中收集与MKL-1的表达相关的数据,对收集到的数据进行荟萃分析,同时使用Kaplan–Meier方法分析MKL-1的表达量与生存的相关性。[结果]从Oncemine数据库中共收集到154项与MKL-1有关的研究,分析表明在MKL-1在9种癌症中表达上升,且在肾透明细胞癌中的表达显著性上升(P <0. 05)。进一步分析发现MKL-1与癌症患者的特征无显著性关系,但与预后成负相关性。最后通过蛋白质网络预测MKL-1相互作用的蛋白。[结论]基于不同数据库深度挖掘提示MKL-1基因在肾透明细胞癌中高表达,并与肾透明细胞癌的预后有显著相关性,有望被用作肾透明细胞癌的治疗的新靶点。
北京泛菌的生长特性及快速鉴定方法研究 下载:83 浏览:496
摘要:
研究分析了杏鲍菇软腐病病原菌北京泛菌的生长特性以及病原菌的快速鉴定方法,从而为杏鲍菇软腐病的防控打下基础。[方法]测定了北京泛菌在不同温度、不同种类抗生素、不同浓度的杀菌剂二氧化氯的生长情况,以及采用特异性引物进行PCR鉴定病原菌。[结果]北京泛菌生长的最适温度28℃,对硫酸链霉素、羧苄青霉素等7类抗生素敏感,在含有50 mg/L的杀菌剂二氧化氯的培养基中不能生长,引物对hrp LF/R、wzx CF/R、tua GF/R和lps DF/R在北京泛菌能够扩增出目的条带。[结论]明确了北京泛菌的生长特性,50 mg/L的杀菌剂能够有效杀灭病原菌,并开发了4对特异性引物用于病原菌的快速、准确鉴定,为杏鲍菇软腐病的防控打下基础。
黄素还原酶Frd181和Frd188对钝齿棒杆菌产精氨酸的影响 下载:83 浏览:507
摘要:
钝齿棒杆菌中有两个黄素还原酶,一个是由frd1编码的F181,另一个是由frd2编码的F188。该文分别对这两个基因进行了敲除,比较二者分别对精氨酸产量的影响。[方法]基因敲除采用的是无痕敲除技术。[结果]敲除frd1的菌株其最终的L-Arg产量达到21. 36 g/L,较出发株提高了10. 6%;葡萄糖消耗速率比出发株慢,但菌体生长量提高显著,提高了约33. 3%。敲除frd2摇瓶发酵产L-Arg的量较出发株提高了3. 15%;菌体生长量介于出发株及敲除frd1的菌株之间;葡萄糖消耗与敲除frd1的菌株相当;敲除frd1的菌株积累NADH最多,产生H2O2最低。[结论]敲除frd1比敲除frd2对提高精氨酸的产量效果显著。