文章-世纪中文出版社

胡悦冷金源孙洁洁王玲玲宋林生《中国水产学报》 2024年2期

摘要:

为研究长牡蛎(Crassostrea gigas)LOX4基因(CgLOX4)在幼虫发育中的表达特征，采用PCR技术扩增CgLOX4的全长cDNA序列，利用荧光定量PCR和整体免疫荧光技术检测CgLOX4在幼虫不同发育时期的表达特征。结果表明：CgLOX4的cDNA全长为1 862bp,开放阅读框为834bp,可编码277个氨基酸，等电点为8.36,预测其氨基酸序列只含有一个保守的HOX结构域；CgLOX4在长牡蛎成体各组织中均有表达，其中在闭壳肌中的表达量显著高于肝胰腺、鳃、血淋巴、性腺和唇瓣组织(P<0.05);CgLOX4在所检测的早期胚胎中均有表达，其中在受精卵和4细胞期的表达量相对较高；CgLOX4阳性信号主要分布在担轮幼虫壳形成区、D型幼虫内脏团和壳顶幼虫消化腺中。研究表明，CgLOX4是长牡蛎早期发育过程中较早激活的转录因子之一，可能在调控幼虫壳形成和消化器官形成等方面发挥重要作用。

干露及恢复对中间球海胆抗氧化能力、细胞凋亡和免疫相关基因表达的影响下载：26 浏览：266

林威港1,2 孙琦3 海航瑜1 刘亚婷1 赵鹏1 常亚青1 马得友1 《中国水产学报》 2024年2期

摘要:

为研究干法运输对中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)活力的影响，采用低温(4℃)干露胁迫12、24、36h后再浸润恢复12h的处理方法，测定了湿质量为(3.57±0.63)g的中间球海胆体腔细胞超氧化物歧化酶(T-SOD)活力、丙二醛(MDA)含量和总抗氧化能力(T-AOC)水平，通过流式细胞仪检测了细胞凋亡情况，利用实时定量PCR分析了不同时间干露胁迫下免疫相关基因LYZ、TLR1及凋亡相关基因Caspase-3和Caspase-9在体腔细胞中的表达情况。结果表明：干露试验组海胆体腔液T-SOD活力、MDA含量和T-AOC水平随干露时间的延长呈现先升高后降低的变化趋势，干露12h时各指标值均达到最高，随后下降，并于复水12h时接近对照组(P>0.05);免疫相关基因LYZ和TLR1总体上随干露时间的延长呈先减弱后增强的表达趋势，分别在干露24、36h时达到峰值，入水恢复12h时两基因的表达量显著低于对照组(P<0.05);发生凋亡的体腔细胞比率随干露时间延长的变化趋势与T-AOC水平的变化趋势相似，干露12h时达到最高值，而Caspase-3、Caspase-9基因的表达量具有时间累积效应，分别在干露24、36h时显著高于对照组和其他处理组(P<0.05)。研究表明，中间球海胆具有一定的耐干露能力，通过抗氧化酶系统维持活性氧自由基的动态平衡，LYZ、TLR1等固有免疫分子和Caspase依赖性细胞凋亡因子在应对干露胁迫、机体维持内稳态的过程中发挥重要作用。

体外传代对大口黑鲈蛙虹彩病毒毒株毒力的影响下载：30 浏览：257

王丛旭1,2 潘晓艺2 周可欣2 穆雪娇2 姚嘉赟2 蔺凌云2 赵建华1 沈锦玉1,2 《中国水产学报》 2023年6期

摘要:

为研究不同代次大口黑鲈蛙虹彩病毒（Largemouth bass ranavirus, LMBV）的病毒特性变化及毒力差异，采用攻毒试验、qPCR、TCID50及二代测序的方法，对LMBV分离株（LMBV-ZJDSS）F5、F35和F65进行致病性、组织中病毒载量变化、病毒滴度和不同代次病毒基因组测序，在LMBV全基组中筛选出4个毒力基因，并对不同地区毒株的毒力基因进行分析。结果表明：攻毒浓度为108.5 TCID50/mL时，F5、F35和F65代毒株15d内引起大口黑鲈（Micropterus salmoides）的死亡率分别为60%、25%和5%;F65代毒株最早产生细胞病变效应（cytopathic effect, CPE）;大口黑鲈肝脏、脾脏和肠的病毒载量较高，不同代次毒株在各组织中均有分布，96h内F65代毒株在各器官组织的病毒载量呈上升趋势，48h内F5代毒株在各器官组织的病毒载量呈上升趋势；对F5和F65代毒株的全基因组测序分析显示，E3、TNFR和ICP18基因编码区未发生突变，遗传稳定性较高，ICP46基因编码区有一处氨基酸由天冬氨酸突变为酪氨酸。研究表明，通过病毒的连续传代，病毒致细胞病变的速度加快，病毒对大口黑鲈的致病性减弱，病毒的毒力有所下降，毒力下降的原因可能是编码ICP46蛋白的氨基酸发生突变，且不同地区LMBV毒株毒力基因差异主要集中在TNFR上。

南京某医院成人耐甲氧西林金黄色葡萄球菌检出情况及耐药基因分析下载：92 浏览：474

张利1 孙林春2 《国际检验医学》 2019年9期

摘要:

目的了解江苏省中西医结合医院2011—2017年成人耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)临床分离株的检出情况及其耐药基因，为临床合理用药提供参考依据。方法采用美国临床实验室标准化协会(CLSI)推荐方法鉴定MRSA。采用纸片扩散法对MRSA菌株进行药物敏感性试验。采用聚合酶链反应(PCR)检测β-内酰胺类耐药基因mecA，氨基糖苷修饰酶基因aac(6′)/aph(2″)、aph(3)-Ⅲ，大环内酯类23s rRNA甲基化酶基因ermA/C，四环素类核糖体保护蛋白基因tetM/K，喹诺酮类耐药基因qnrA/B和耐消毒剂基因qacA/B。结果 MRSA的总检出率为31.95%，主要分离自痰液和创口分泌物样本；检出率居前3位的科室依次为呼吸科、外科和重症监护病房。未检出对万古霉素、利奈唑胺和替加环素耐药的MRSA菌株；仅有0.49%的MRSA对奎奴普汀耐药，对复方磺胺甲噁唑、利福平、环丙沙星、四环素、庆大霉素、克林霉素、红霉素的耐药率分别为11.18%、11.57%、21.47%、63.63%、44.31%、59.41%、62.35%。多重耐药基因mecA阳性率为100%，aac(6′)/aph(2″)、aph(3)-Ⅲ、ermA/C、tetM/K、qnrA/B、qacA/B基因检出率分别为36.67%、27.94%、68.43%、57.35%、23.63%和52.45%。结论 2011—2017年江苏省中西医结合医院成人MRSA多重耐药基因检出率高。MRSA对多种抗菌药物都不同程度耐药，临床应以药物敏感性试验结果为合理用药的最主要依据。

马氏珠母贝α-Tubulin基因结构、SNP筛选及耐低温相关性分析下载：41 浏览：268

刘雅1,2 李松谕1 赖卓欣2 钟如卓2 王庆恒2,3 邓岳文2,3 《中国水产学报》 2023年4期

摘要:

为了探究马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)α-Tubulin基因在低温适应性中的作用，通过RACE克隆技术获得马氏珠母贝α-Tubulin基因，分析了α-Tubulin基因在低温胁迫下的表达趋势，并筛选和比较了马氏珠母贝耐低温选育系(R)F3和北部湾野生群体(W)的α-Tubulin编码区SNP位点。结果表明：马氏珠母贝α-Tubulin基因总长为2 107bp,可编码454个氨基酸，具有典型的Tubulin和Tubulin-C结构域；全组织定量显示，α-Tubulin基因在所有组织中均有表达，在足部中表达量最高(P<0.05);低温胁迫时，鳃组织中α-Tubulin基因在低温组(12、17℃)的表达量均在72h时达到最高，且显著高于对照组(22℃)(P<0.05);α-Tubulin外显子区域共有34个SNP,其中3个SNP位点的基因型频率在R和W群体间有显著性差异(P<0.05);连锁不平衡分析显示，R群体单倍型CCTCAGCGCC的频率明显高于W群体。研究表明，α-Tubulin为参与调节马氏珠母贝低温适应过程中的候选基因，筛选出的与抗低温性状相关的SNP位点g.111071125及优异单倍型CCTCAGCGCC,可作为选择育种的候选标记。

尼罗罗非鱼跨膜Bax抑制剂母体6基因Tmbim 6的克隆、表达及功能鉴定下载：53 浏览：278

巫祎琴陈福暖张志强江栢坚简纪常黄瑜《中国水产学报》 2023年3期

摘要:

为了解跨膜Bax抑制剂母体6(transmembrane Bax inhibitor motif containing 6, TMBIM 6)在尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)病原体感染中的作用，利用聚合酶链式反应(PCR)对Tmbim 6基因进行克隆与鉴定，并采用实时荧光定量PCR(qPCR)分析Tmbim 6在健康尼罗罗非鱼(体质量为80～100g)的组织分布模式及无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)、Poly I:C模拟病毒刺激后的表达变化。结果表明：尼罗罗非鱼Tmbim 6开放阅读框为714bp,可编码237个氨基酸，包含6个跨膜结构域和1个C-末端基序；亚细胞定位显示，尼罗罗非鱼TMBIM 6定位于细胞质，双荧光素酶报告基因系统检测发现，Tmbim 6在HEK-293T细胞中过表达后极显著抑制NF-κB通路(P<0.01);qPCR分析显示，Tmbim 6基因在所检测的组织中广泛分布，在肝脏和肌肉中的表达量最高；经无乳链球菌感染和Poly I:C刺激后，Tmbim 6在肝脏、脾脏、头肾、脑和肠道中的表达水平均显著上调(P<0.05)。研究表明，尼罗罗非鱼TMBIM 6参与了无乳链球菌感染和Poly I:C刺激后的细胞应激过程及免疫反应。

两种单色鲤皮肤转录组特征分析下载：49 浏览：291

史东杰1,2 张强3 伍仕弘4 高坚5 魏东6 张欣1,2 王赛赛1,2 孙砚胜1,2 姜巨峰7 李文通1,2 杨昊坤1,4 《中国水产学报》 2023年2期

摘要:

为了探究全红鲤(Cyprinus carpio)和全黄鲤的基因资源，采用Illumina Hi-seq测序技术对两种单色鲤的皮肤进行转录组测序，并对差异表达基因进行注释和富集分析。结果表明：对体长为(33.42±0.24)cm的全红鲤和体长为(38.75±0.43)cm的全黄鲤皮肤测序，分别获得干净数据(clean reads)为129 222 850和130 869 572个；与Nr、Nt、COG、GO、KEGG、Pfam和Uniprot数据库中已知基因进行比对，分别有58 782、61 490、11 468、31 206、31 581、61 385和51 805个基因获得注释，7个数据库中均有注释的基因数为8 378个；在全红鲤和全黄鲤皮肤中存在4 822个差异表达基因，其中，显著上调1 929个，显著下调2 893个；取其中9个差异表达基因进行qRT-PCR验证，证实了转录组数据结果的可靠性；在差异表达基因中，筛选获得了部分参与体色调控的基因，包括mitfa、ednrA、wnt7、agouti和mif等；KEGG分析发现，差异表达基因极显著富集在甘露糖与果糖代谢、糖酵解/糖原异生途径、碳代谢、磷酸戊糖途径和酪氨酸代谢等43条通路；对酪氨酸代谢和黑色素合成通路分析发现，与红色素和黄色素合成相关的基因mif、mif4g、agouti、ednrA和ednrB等显著上调，与黑色素合成相关的基因tyr、tyrp1、mitfa和wnt7等显著下调；差异基因变异分析发现，全红鲤和全黄鲤中均存在的单核苷酸多态性标记(SNP)共388 673个。研究表明，两种单色鲤皮肤组织中差异表达基因主要富集在能量代谢、生长和免疫等通路中，获得的转录组信息可为今后锦鲤分子标记的开发及功能基因的克隆、编辑和功能分析等提供基础数据。

尼罗罗非鱼高迁移率族蛋白4(TOX4)基因克隆及其在细菌感染过程中的表达特征下载：51 浏览：279

江栢坚1,2 张志强1,2 巫祎琴1,2 于劼豪1,2 黄瑜1,2 简纪常1,2 《中国水产学报》 2023年1期

摘要:

为了解析与胸腺细胞选择相关的高迁移率族蛋白4(tox high mobility group box family member 4,TOX4)在尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)响应无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)感染过程中的功能，利用聚合酶链式反应(PCR)克隆和鉴定尼罗罗非鱼TOX4基因(GenBank登录号：XP003458812)的开放阅读框(open reading frame, ORF)序列，对推导的TOX4氨基酸序列进行生物信息学分析，分析其亚细胞定位特征，以及在尼罗罗非鱼头肾淋巴细胞亚群的分布特征，并利用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析TOX4基因在健康鱼各组织及响应无乳链球菌感染过程中的表达模式。结果表明：尼罗罗非鱼TOX4基因的ORF全长为2 004bp,编码667个氨基酸，预测TOX4蛋白的相对分子质量为69 060,理论等电点为4.69,无信号肽序列及跨膜结构，具有一个HMG保守结构域；亚细胞定位结果显示，TOX4蛋白主要表达于细胞核中；多序列比对及系统进化分析均显示，尼罗罗非鱼与斑马拟丽鱼(Maylandia zebra) TOX4氨基酸序列的同源性最高；qRT-PCR分析显示，TOX4基因在健康尼罗罗非鱼各组织中均有表达，且在血液中表达量最高；单细胞转录组数据分析显示，TOX4基因主要在尼罗罗非鱼非特异性细胞毒性细胞(nonspecific cytotoxic cell, NCC)和巨噬细胞(macrophage, Mφ)中表达；经无乳链球菌感染后，尼罗罗非鱼脑、头肾、肠道和脾脏中TOX4基因的表达量显著上调，并在感染后12h(脑、头肾、肠道)和48h(脾脏)达到峰值。研究表明，TOX4可能参与尼罗罗非鱼响应细菌感染的免疫应答过程。

肝癌中Hippo-YAPTAZ信号通路的研究进展下载：225 浏览：2519

贾浩艺《医学研究杂志》 2021年12期

摘要:

Hippo信号通路是一种果蝇研究中所发现的观察指标，包括MStl/2、 WW45、 Mobla/lb 和 LatSl/2几个组成部分，其能够借助系列酶联反应过程，将转录辅激活因子 YAP 进入细胞核的通路彻底阻断，有助于人体内环境与组织器官的稳定以及细胞凋亡与增值过程的平衡。如果Hippo信号通路发生表观遗传学特征改变或是组件基因突变等，都会导致其活性丧失，使得人体细胞核内YAP会出现过度活化或是过度表达的特征，诱发细胞过度增殖和抑制凋亡的情况，这也是肝癌发生和发展的主要影响因素之一。本研究对肝癌中的Hippo-YAPTAZ信号通路进行了系统分析，现报道如下。

嗜水气单胞菌ompA、flaA基因重组干酪乳杆菌对鲤生长及免疫效果分析下载：78 浏览：453

赵林辉1，2，3，4 田佳鑫2，3，4 孔祎頔2，3，4 彭思博1，2，3，4 单晓枫4 王桂芹2，3，4 《水产研究进展》 2022年2期

摘要:

为构建嗜水气单胞菌ompA和flaA基因重组干酪乳杆菌并分别检测其表达产物对鲤生长及免疫效果的影响，实验将目的基因克隆至乳酸菌穿梭表达质粒pPG612中，并电转至干酪乳杆菌中，经诱导后包被饲料对鲤进行饲养56d，称重并采集血清及组织，分析生长指标及免疫指标变化。在56d饲养免疫结束后结果显示，生长指标显示重组干酪乳杆菌组与对照组无显著差异，表明重组干酪乳杆菌对生长无影响；免疫效果分析显示，血清中IgM表达水平显著上升。血清中AKP、LZM、SOD、CAT、C3和C4也均显著升高。荧光定量PCR检测发现，免疫后肝脏、脾脏、头肾及肠组织中的细胞免疫因子基因IL-1β、IL-8、TNF-α、NF-κB、TLR5及MYD88的表达水平有不同程度的显著提升；其中TLR5及MYD88表达量在Lc-mcs-flaA组高于Lc-mcs-ompA组。攻毒后Lc-mcs-ompA与Lc-mcs-flaA组免疫保护率分别为59%与54%，显著高于对照组。研究表明，本实验构建的重组干酪乳杆菌Lc-mcs-ompA与Lc-mcs-flaA免疫鲤能刺激机体产生免疫应答反应，进而提高自身存活率，为预防鱼类嗜水气单胞菌感染的口服免疫制剂的研发奠定基础并提供科学理论依据。

王研高思祺匡倩瑶刘怡宁田燚《中国水产学报》 2022年5期

摘要:

为研究低盐胁迫对刺参Apostichopus japonicus(16.38g±1.27g)体内离子浓度及钠钾ATP酶活力的影响，以及低盐胁迫与miRNA间的调控关系，试验取低盐度(18)胁迫0(对照)、6、24、48h时的刺参体腔液，测定其钠、氯、钾离子浓度及钠钾ATP酶活力。结果表明：低盐胁迫后，刺参体腔液中钠离子浓度在6h时显著升高(P<0.05),随胁迫时间的延长钠离子浓度有所降低，氯离子和钾离子浓度均显著低于对照组(P<0.05)且均在6h时浓度最低，钠钾ATP酶活力在6h时低于对照组，在24h时出现最低值；microRNAs(miRNAs)前体序列和成熟序列分析显示，miR-2011、miR-124和miR-2010均能形成稳定的茎环结构，序列相对保守；通过miRNAs与靶基因间的序列分析，获得3个差异表达的miRNAs(miR-2011、miR-2010和miR-124)及互作的靶基因；miR-2011、miR-2010和miR-124的miRNA表达量在盐度胁迫后均呈现上调，miR-2011和miR-2010的表达量在低盐胁迫48h时达到最大，分别为对照组(0h)的80倍和24倍；序列预测分析获得miR-2011的靶基因为PPM1L和PBK,miR-2010的靶基因为PPM1L,miR-124的靶基因为EGF3、IMPA1。研究表明，刺参miR-124、miR-2011和miR-2010 3个盐度相关的miRNAs序列相对保守，且在盐度胁迫后均能够被诱导表达，从而参与刺参盐度胁迫的响应过程。

Lennox-Gastaut综合征合并孤独症与智力发育障碍的临床特征及危险因素分析下载：82 浏览：510

何娜1,2 黎冰梅1,2 汪洁1,2 刘晓蓉1,2 李斌1,2 卞文君1,2 区锶文1,2 高志炜1,2 廖卫平1,2 汤斌1,2 《神经科学研究》 2019年7期

摘要:

探讨Lennox-Gastaut综合征(LGS)患者中孤独症、智力发育障碍的共患发生率、临床特点及临床影响因素。方法收集广州医科大学附属第二医院癫痫中心自2012年6月至2018年6月确诊为LGS的患者64例, 采用儿童孤独症家长评定量表(ABC)和孤独症医生评定量表(CARS)对患儿进行孤独症评估;采用《中国儿童韦氏智力量表》(C-WISC)和《Gesell儿童发育诊断量表》对患儿进行智力发育评估, 分析不同临床因素对LGS并发孤独症及智力发育障碍的影响。结果 64例LGS患者中仅3例(4.7%)患者合并有孤独症, 其平均ABC和CARS评分分别为80分和40分。不同年龄分组中, 起病年龄<1岁患者ABC和CARS评分最高, 分别为(40.9±26.7)分和(26.0±8.9)分, 与其他年龄组患者相比, 差异有统计学意义(P<0.05)。治疗药物数量分组中, 服用≥3种抗癫痫药物(AEDs)患者ABC和CARS评分最高, 分别为(27.8±22.8)分和(22.2±8.7)分;与服用1～2种AEDs患者相比, 差异有统计学意义(P<0.05)。此外, 不同癫痫发作频率、具有/不具有明确病因的LGS患者, ABC和CARS评分差异也具有统计学意义(P<0.05)。64例患者中50例(78.1%)患者呈现不同程度的智力障碍, 其中重度智力障碍为主要类型, 占31.3%。轻度、中度以及极重度智力障碍患者人数分别为12(18.8%)、7(10.9%)和11(17.2%)。与不伴智力发育障碍患者比较, 伴有智力障碍患者起病年龄更低、脑电图特征表现为慢背景活动比例更高、具有症状性病因的比例更高, 差异有统计学意义(P<0.05)。结论癫痫起病年龄早, 癫痫发作频繁, 服用≥3种AEDs且具有明确病因的LGS患者合并孤独症的几率更高。起病年龄是LGS患者合并智力障碍的独立危险因素。

浙江缢蛏群体糖原含量变化与gys基因多态性的关联分析下载：83 浏览：486

陈燕园1，2 刘圣3 何京2 姚韩韩2 林志华2，3 董迎辉2 《水产研究进展》 2021年6期

摘要:

为了探讨缢蛏糖原含量与糖原合酶基因(sc-gys)的特性及其用于分子标记辅助育种的可行性，实验检测了浙江缢蛏群体糖原含量的周年变化，克隆获得糖原合酶基因的cDNA全长序列，分析其在不同组织、不同月份的表达差异，并进一步筛选出与糖原含量相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)位点。结果显示，养殖缢蛏在2—6月糖原含量较高，4月达到最大值。sc-gys基因的cDNA全长为2 402bp，开放阅读框为2136bp，编码711个氨基酸。荧光定量PCR结果显示，sc-gys基因主要在外套膜和足中表达，其不同月份的表达水平与糖原含量周年变化规律一致，4月表达量显著高于其他月份，表明该基因与糖原合成关系密切。在"甬乐1号"品种和台州野生群体sc-gys基因的外显子区共筛选到2个与糖原含量相关的SNP位点，且两位点之间没有连锁不平衡，优势基因型组合个体的糖原含量比群体均值提高11.8%，这些位点和优势基因型组合可为缢蛏糖原含量的遗传改良提供候选标记。

斑鳢叉头框转录因子基因Foxl2的克隆表达及性类固醇激素刺激下的表达响应下载：51 浏览：337

吴燕铎1,2 欧密1 高丹丹1,2 陈昆慈1,2 罗青1 刘海洋1 赵建1,2 《中国水产学报》 2022年3期

摘要:

为探究叉头框转录因子Foxl2基因(forkhead transcription factor gene 2)在斑鳢Channa maculata性腺发育过程中的作用，采用RT-PCR和RACE技术克隆出斑鳢Foxl2基因，利用qRT-PCR解析Foxl2基因在雌雄斑鳢1龄成鱼组织、不同发育时期性腺中的表达情况，以及外源性激素诱导后雌雄斑鳢性腺中Foxl2的表达变化，通过酶联免疫法测定性腺不同发育时期雌雄斑鳢血清中的雌性激素(estrogen, E)总含量，并利用免疫组化技术检测性腺中Foxl2蛋白表达的细胞类型。结果表明：克隆获得斑鳢Foxl2 cDNA序列全长为1 939bp,开放阅读框(ORF)为921bp,共编码306个氨基酸；组织表达分析显示，Foxl2在卵巢中表达量最高且极显著高于精巢(P<0.01),但在鳃和脑组织中雄鱼表达量显著高于雌鱼(P<0.05);性腺发育时期表达分析显示，Foxl2在卵巢中表达量高于精巢，且在孵化出膜后105d时，卵巢中表达量达到最高，精巢中表达量最低，两者表达量存在极显著性差异(P<0.01),血清中雌激素总含量变化与之相似；免疫组织化学检测显示，Foxl2蛋白表达于斑鳢卵巢成熟卵母细胞周围的颗粒细胞，精巢中未检测到Foxl2表达信号；经外源性类固醇激素17α-乙炔基雌二醇(17α-ethynylestradio, EE2)和17α-甲睾酮(17α-methyltestosterone, MT)处理后，卵巢中Foxl2的表达均受到抑制，但精巢中表达水平被EE2上调，被MT下调。研究表明，Foxl2基因在斑鳢性腺中呈现明显的性别二态性表达，推测其参与卵巢的发育和维持，通过外源激素诱导，Foxl2可能响应性类固醇激素的调节，本研究从mRNA和蛋白层面初步揭示了Foxl2在斑鳢性腺发育中的重要作用，为深入研究其性别分化机制及性别控制技术提供了科学参考。

RNF213基因rs6565666位点多态性与广东省颅内囊状动脉瘤患者发病的关系下载：81 浏览：509

范海燕郭慎全陈运昌张炘李西锋何旭英段传志《神经科学研究》 2019年5期

摘要:

探讨RNF213基因rs6565666位点多态性与广东省颅内囊状动脉瘤患者发病之间的关系。方法选择南方医科大学珠江医院神经外科自2016年2月至2018年10月收治、经数字减影血管造影(DSA)检查证实的250例颅内囊状动脉瘤患者为试验组, 同期250例经CT血管造影(CTA)、磁共振血管成像(MRA)、DSA检查证实无颅内动脉瘤的住院患者或健康志愿者为对照组。采用聚合酶链式反应-连接酶检测反应(PCR-LDR)检测2组受试者外周血RNF213基因rs6565666位点的基因型并比较。结果与对照组比较, 试验组患者rs6565666位点AG、AA基因型所占比例较高, GG基因型所占比例较低, 差异均有统计学意义(P<0.05)。与对照组比较, 试验组患者rs6565666位点等位基因A所占比例较高, 差异有统计学意义(P<0.05)。试验组患者中动脉瘤破裂112例, 未破裂138例。破裂组和未破裂组患者rs6565666位点基因型分布差异无统计学意义(P> 0.05)。结论 RNF213基因rs6565666位点多态性与广东省颅内囊状动脉瘤患者发病相关。

珍珠龙胆石斑鱼紧密连接蛋白基因Claudin-3与Claudin-12的克隆及精氨酸干预下的肠道表达下载：57 浏览：326

李广1 崔晓1 姚春凤2 陈东鸿1 何凯1 陈冠霖1 韩煜轩1 杨奇慧1,3 迟淑艳1,3 《中国水产学报》 2022年2期

摘要:

为评价Claudin-3与Claudin-12基因在珍珠龙胆石斑鱼Epinephelus fuscoguttatus♀×E.lanceolatus♂生长和肠道黏膜屏障中的作用，通过同源克隆及RACE PCR技术克隆珍珠龙胆石斑鱼Claudin-3和Claudin-12基因的全长，采用qRT-PCR技术分析Claudin-3和Claudin-12基因在珍珠龙胆石斑鱼脑、鳃、皮肤、肌肉、肝脏、胃、前肠、中肠、后肠、头肾、体肾、脾和心脏13种组织的表达情况，并通过饲料精氨酸干预评估上述两个基因在肠道的表达情况。结果表明：Claudin-3 cDNA全长序列为1 544bp,包括一个153bp的5′末端非翻译区(UTR)和743bp的3′UTR,Claudin-3的开放阅读框(ORF)为648bp,可编码215个氨基酸的蛋白，预测该蛋白相对分子质量为23 100;Claudin-12 cDNA全长序列为1 236bp,包括一个118bp的5′UTR和92bp的3′UTR,Claudin-12的ORF为1 026 bp,可编码341个氨基酸的蛋白，预测该蛋白相对分子质量为37 400;系统进化树和氨基酸序列比对显示，珍珠龙胆石斑鱼Claudin-3与斜带石斑鱼亲缘关系最近，同源性最高，一致性高达98.14%,珍珠龙胆石斑鱼Claudin-12与䲟的亲缘关系最近，同源性最高，一致性高达91.75%;Claudin-3和Claudin-12基因在被检测的13种组织中均有表达，Claudin-3 mRNA在鳃和体肾中表达量最高(P<0.05),其次是中肠和肝脏，Claudin-12在脑中表达量最高(P<0.05),其次是中肠和后肠；饲料中精氨酸含量为3.06%时，珍珠龙胆石斑鱼增重率及肠道Claudin-3和Claudin-12基因表达水平显著高于1.96%和3.74%精氨酸组(P<0.05)。研究表明，Claudin-3和Claudin-12基因表达在适宜精氨酸水平的影响下上调，可维护石斑鱼肠道黏膜屏障完整，并促进鱼体生长。

尼罗罗非鱼清道夫受体基因Scara3的克隆及病原微生物刺激后的表达响应下载：43 浏览：337

胡惠玲1,2 汪志文1,2 黎源1,2 鲁义善1,2 简纪常1 《中国水产学报》 2022年2期

摘要:

为探究清道夫受体3(scavenger receptor class a member 3,Scara3)在尼罗罗非鱼Oreochromis niloticus抵御病原微生物过程中的作用，采用聚合酶链式反应克隆得到罗非鱼Scara3基因，利用荧光定量PCR技术分析Scara3在健康尼罗罗非鱼组织分布及细菌、病毒感染后的表达情况，并进行亚细胞定位分析。结果表明：克隆得到尼罗罗非鱼Scara3基因cDNA全长序列为3 889bp,开放阅读框(ORF)为1 827bp,编码608个氨基酸，具有跨膜结构域和胶原(Collagen)结构域；多序列比对发现，Scara3氨基酸序列在脊椎动物中相对保守；亚细胞定位显示，Scara3蛋白在全细胞分布；荧光定量PCR分析显示，Scara3基因在健康罗非鱼各组织中均有表达，在血液、肠道、皮肤和胸腺等组织中表达量较高且显著高于其他组织(P<0.05);经脂多糖(LPS)、灭活无乳链球菌Streptococcus agalactiae和聚肌胞苷酸(Poly I:C)刺激罗非鱼头肾白细胞后，Scara3表达量显著上调(P<0.05),经灭活无乳链球菌和Poly I:C刺激后，肠道、头肾和皮肤组织中的基因表达量表现出时序性。研究表明，尼罗罗非鱼在对细菌和病毒感染的免疫反应活动中，Scara3基因起着重要作用，本研究结果为后期硬骨鱼类中Scara3基因的功能研究提供了科学参考。

鱼源气单胞菌的毒力基因检测、分型及致病力下载：75 浏览：460

刘小芳1，2 任燕1 张德锋1 巩华1 石存斌1 常藕琴1 潘厚军1 《水产研究进展》 2021年5期

摘要:

为调查鱼源气单胞菌毒力基因与其致病力的相关性，以2009—2018年从不同患病鱼分离的173株气单胞菌为研究对象，通过检测毒力相关基因、测定溶血活性、腹腔注射感染异育银鲫等方法开展评价。通过管家基因gyrB分子鉴定结果显示，173株气单胞菌中维氏气单胞菌(119/173，68.9%)和嗜水气单胞菌(50/173，28.9%)是主要流行的菌株。10个毒力基因aer(162/173，93.64%)、act(131/173，75.72%)、ast(55/173，31.79%)、alt(58/173，33.53%)、lip(152/173，87.86%)、exu(154/173，89.02%)、fla(143/173，82.66%)、gcaT(148/173，85.55%)、 eprCAI(41/173，23.70%)和ahyB(51/173，29.48%)普遍存在于173株气单胞菌中。依据检测到的毒力基因数量从多到少分布情况，这些菌株可分为7大类(Ⅰ～Ⅶ)53个毒力基因型。大部分嗜水气单胞菌检测到8～10个毒力基因，主要分布于Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类基因型；维氏气单胞菌的eprCAI、ahyB、ast和alt等4个毒力基因检测率低，主要分布于Ⅳ、Ⅴ和Ⅵ类基因型。大部分气单胞菌(94.22%，163/173)具有溶血活性。代表性毒力基因型的38株维氏气单胞菌和20株嗜水气单胞菌腹腔注射异育银鲫攻毒结果显示，3.0×106 CFU/尾的剂量下，3株维氏气单胞菌使鲫死亡率达80%～100%，16株嗜水气单胞菌使鲫死亡率达90%～100%。研究表明，维氏气单胞菌是目前最主要流行的气单胞菌，但其检测到的毒力基因普遍少于嗜水气单胞菌，且对异育银鲫的致病力普遍弱于嗜水气单胞菌。本研究能够为气单胞菌败血症的流行病学调查和疫苗研究提供理论依据。

团头鲂Hox基因家族的鉴定、进化与表达分析下载：82 浏览：484

刘宁黄欣刘寒王卫民《水产研究进展》 2021年5期

摘要:

为探究团头鲂Hox的分布、进化及表达调控，实验基于团头鲂全基因组数据，结合生物信息学分析方法对Hox基因家族进行鉴定、染色体分布、系统进化和表达分析。结果显示，团头鲂基因组中鉴定有49个Hox，根据系统进化树聚集为5个亚类；49个Hox分属于7个基因连锁群(HoxAa、HoxAb、HoxBa、HoxBb、HoxCa、HoxCb和HoxDa)，并且不均匀地分布在5条染色体上；团头鲂Hox基因家族成员具有不同的表达模式，在肌肉中的表达水平与斑马鱼所有Hox的表达存在显著差异；团头鲂不同发育阶段及不同组织的转录组结果显示，在HoxA基因群中，HoxA2a和HoxA3a在幼鱼阶段高表达，其他基因在肌肉、肌间刺及结缔组织中表达量低甚至不表达；HoxB基因群中，HoxB9a、HoxB3a、HoxB8a、HoxB1b、HoxB5a和HoxB5b在幼鱼阶段高表达，HoxB7a、HoxB10a和HoxB9a在成鱼肌肉、结缔组织及肌间刺中高表达；HoxC基因群中，HoxC3a和HoxC4a在幼鱼阶段高表达，HoxC3a和HoxC8a在成鱼的3个组织都有表达；HoxD基因群中，HoxD9a、HoxD10a和HoxD11a在胚胎S2期表达量较高。研究表明，Hox在团头鲂早期胚胎时期和肌间刺的形成中有表达，提示团头鲂肌间刺的形成可能受Hox基因家族调控。

脊尾白虾隐花色素基因cry1的克隆及其功能分析下载：88 浏览：482

朱佶轩1 戴琴1 高威1 段健诚1 宋崇阳1 张攀1 阎斌伦1，2，3 高焕1，2，3 《水产研究进展》 2021年5期

摘要:

为探究隐花色素基因(cry1)在甲壳类中的节律调节功能，实验根据脊尾白虾转录组序列，利用RACE技术获得了脊尾白虾cry1的cDNA序列全长并对其进行功能分析。脊尾白虾cry1全长2190bp，开放阅读框1845bp，5′端非编码区为241bp，3′端非编码区为104bp，共翻译出614个氨基酸，预测蛋白质的分子质量为70.5ku，理论等电点为5.09。同源性分析显示，脊尾白虾cry1与凡纳滨对虾的同源性最高，为71.6%。荧光定量分析结果显示，脊尾白虾cry1在眼柄、鳃、心脏、胃、肝胰腺、性腺、肌肉、肠道和腹索神经中均有表达，其中眼柄的表达量最高，性腺和心脏次之；不同时段的表达结果发现，其表达量在日节律(24 h)中表现出先下降再上升的趋势。不同光色条件下RNA干扰(RNA interference， RNAi)结果显示，注射小干扰RNA(siRNA)后3～6 h蓝光光照下脊尾白虾cry1的表达量显著高于白光光照，9～24 h蓝色和白色光照下的表达量无显著差异，而RNA干扰组的表达量显著低于对照组，此结果表明cry1可能主要响应蓝光周期节律。目前对甲壳类生物钟的研究较少，该研究为深入探究甲壳类生物钟基因的调控机制提供帮助。

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