我要投稿 查看投稿进度
学术期刊
在线客服
客服电话：400-188-5008
客服邮箱：service@ccnpub.com
投诉举报：feedback@ccnpub.com
人工客服

工作时间（9：00-18：00）
官方公众号

科技成果·全球共享

请选择 目标期刊

青海湖裸鲤肠道菌群对不同盐度胁迫的响应 下载：26 浏览：239

赵子丰1 金文杰1,2 赵静1 王蓉1 祁洪芳3 李瑾3 白鹏1,2 李长忠1,2 《中国水产学报》 2024年4期

摘要:
为了探讨盐度胁迫对青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)肠道菌群结构的影响，基于三代全长16S扩增子测序技术，对不同盐度(0、5、10、15)下青海湖裸鲤肠道内容物进行微生物测序及信息分析。结果表明：在门水平上，不同盐度组青海湖裸鲤肠道菌群的相对丰度不同，对照组(盐度0)和低盐度组(盐度5、10)肠道菌群中，相对丰度较高的是梭杆菌门(Fusobacteria)和变形菌门(Proteobacteria),其次是厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes),疣微菌门(Verrucomicrobia)、放线菌门(Actinobacteria)和浮霉菌门(Planctomycetes)等也占有一定比例，高盐度组(盐度15)中以变形菌门、拟杆菌门、浮霉菌门和疣微菌门为主要菌群；在属水平上，对照组和低盐度组肠道菌群中鲸杆菌属(Cetobacterium)和气单胞菌属(Aeromonas)相对丰度较高，其次是弧菌属(Vibrio)和希瓦氏菌属(Shewanella),高盐度组中以弧菌属、假红杆菌属(Pseudorhodobacter)和卤蕨属(Haloferula)为主要菌群。研究表明，低盐度(盐度≤10)胁迫对青海湖裸鲤肠道菌群结构的影响不大，而高盐度(盐度≥15)胁迫则会抑制青海湖裸鲤肠道菌群和优势菌群的生长且影响较大。

基于转录组测序的花斑裸鲤SSR、SNP和InDel位点特征分析 下载：29 浏览：256

贺彩霞1 李长忠1 金文杰1 保长虹1 简生龙2 李昭楠1 王丽楠1 严青春1 王振吉2 王国杰2 陈艳霞1 《中国水产学报》 2024年2期

摘要:
为利用分子标记规模化开发与辅助花斑裸鲤（Gymnocypris eckloni）良种选育，以花斑裸鲤（2+龄）的鳃、肾脏和肝脏组织为材料，经总RNA提取和cDNA文库构建后采用Illumina Novaseq 2000平台进行转录组测序，并采用MISA和GATK3软件分析转录组的SSR、SNP和插入缺失标记（InDel）位点特征。结果表明：在486 221条Unigenes序列中共发现了128 727个SSR,出现频率为26.47%,平均每3.76 kb出现1个SSR;花斑裸鲤SSR包括6个重复类型，以单碱基和二碱基重复基元类型为主，分别占总SSR位点数的46.53%和42.45%,重复基元类型共77种，其中，A/T和AC/GT两种基元的出现频率最高，是花斑裸鲤SSR的优势重复基元；所有重复次数中出现次数最多的为5～15次，占所有SSR位点的87.52%;通过GATK3软件搜索得到399 080个SNP位点，转换类型多于颠换类型，分别占总SNP的56.29%和43.71%,转换类型中A/G发生频率略高于C/T,而颠换类型中A/T发生频率最高，C/G发生频率最低；InDel分析显示，从花斑裸鲤转录组Unigenes中共筛选出254 065个InDel位点，平均每1 903 bp出现1个InDel位点，且SNP位点和InDel位点均以含1个位点的Unigenes数最多。研究表明，花斑裸鲤转录组中SSR、SNP和InDel位点非常丰富，这些位点对花斑裸鲤种质资源鉴定、种群遗传学研究及保护管理具有重要价值。
[1/1]
|<
<
1
>
>|
在线客服：：点击联系客服
联系电话：：400-188-5008
客服邮箱：：service@ccnpub.com
投诉举报：：feedback@ccnpub.com
人工客服

工作时间（9：00-18：00）
官方公众号

科技成果·全球共享