目的：了解疾控中心在微生物检验过程中存在的问题，并提出相应的应对措施。方法：采用计算机随机抽取的办法，选取辖区中心工作的36名医务工作者，采用某县疾控中心自行编制的调查表，对入组人员进行抽样，并对其问题进行分析，提出应对措施。结果：36.11%的受访对象反映出了工作配置不平衡问题，16.67%的受访对象反映出了检验仪器的落后，22.22%的受访者认为样本收集不规范，13.89%的受访者认为检验环境是有问题的，11.11%的受访者是有其他问题。结论：目前，我国疾控中心开展的微生物检测工作中出现了许多问题，应采取相应的措施，合理配置人手，引进先进的仪器，并建立完善的标本收集和管理体系。