2015年《生态文明体制改革总体方案》中将国家公园体制改革作为一项重要任务，国家公园成为我国自然保护地体系中最新、最重要的一个类型，成为自然保护地体制和体系改革的重要载体和切入点。祁连山国家公园作为西北地区的“安全屏障”，其生态环境长期遭受严重破坏，原有的保护地体系不能解决生态保护和经济经济发展之间的矛盾，使自然保护地生态破坏更加严重，同时也限制当地经济的发展，本文分析了祁连山国家公园现状和存在的主要问题并提出相应的完善措施，从而建立有效的祁连山国家公园生态环境保护体制。